Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IfnabL7MTU6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IfnabL7MTU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms