Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc180J3QNE4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc180J3QNE4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms