Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pabpc4lG5E8X2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms