Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef1G3X9K3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef1G3X9K3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef1G3X9K3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms