Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28048F7BCN0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms