Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc141E9Q8Q6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc141E9Q8Q6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms