Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col22a1E9Q7P1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col22a1E9Q7P1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms