Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
BC005561E9Q5E2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BC005561E9Q5E2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BC005561E9Q5E2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms