Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms