Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pkhd1E9PZ36 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkhd1E9PZ36 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkhd1E9PZ36 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pkhd1E9PZ36 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms