Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc175E9PVB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc175E9PVB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms