Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Soga1E1U8D0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga1E1U8D0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga1E1U8D0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms