Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hfm1D3Z4R1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hfm1D3Z4R1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hfm1D3Z4R1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms