Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930467E23RikD3Z1P8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930467E23RikD3Z1P8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms