Protein–RNA interactions for Protein: D3YV11

Gm5475, Predicted gene 5475, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5475D3YV11 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5475D3YV11 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5475D3YV11 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms