Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah3B2RWG3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms