Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc22a28B2RT89 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms