Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prr29B1ARI9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms