Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931406B18RikA2RSL7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms