Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn3aA2ASI5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scn3aA2ASI5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scn3aA2ASI5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms