Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Frmpd1A2AKB4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Frmpd1A2AKB4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Frmpd1A2AKB4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms