Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm11A2AGX3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm11A2AGX3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms