Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4921501E09RikA0A0R4J054 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms