Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 1810011H11Rik-202ENSMUST00000227060 496 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC140244.1-201ENSMUST00000228454 229 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Gtpbp6Q3U6U5 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd7-201ENSMUST00000045652 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp6Q3U6U5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Nanog-202ENSMUST00000112580 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms