Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V9GYV3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYV3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYV3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYV3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
V9GYV3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYV3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms