Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt6bQ9Z331 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms