Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd4Q9Z2D7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms