Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn8Q9Z260 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn8Q9Z260 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms