Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddx39bQ9Z1N5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms