Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setbp1Q9Z180 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Setbp1Q9Z180 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setbp1Q9Z180 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 525.9 ms