Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf15Q9Z0J7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf15Q9Z0J7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms