Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn1Q9Z0I7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms