Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme4Q9WV84 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme4Q9WV84 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms