Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lemd3Q9WU40 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lemd3Q9WU40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms