Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms