Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plod2Q9R0B9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms