Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dkk3Q9QUN9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dkk3Q9QUN9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms