Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf1Q9JM58 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crlf1Q9JM58 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Crlf1Q9JM58 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crlf1Q9JM58 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crlf1Q9JM58 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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