Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms