Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gde1Q9JL56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gde1Q9JL56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms