Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm7Q9ESD6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm7Q9ESD6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms