Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc4Q9ES56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc4Q9ES56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms