Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mkrn2Q9ERV1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mkrn2Q9ERV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mkrn2Q9ERV1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms