Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slco1c1Q9ERB5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slco1c1Q9ERB5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms