Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufa8Q9DCJ5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms