Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1dQ9DC28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1dQ9DC28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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