Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde1Q9DBZ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms