Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9S1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9S1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9S1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms