Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn22Q9D7U6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn22Q9D7U6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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