Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmigd1Q9D7L8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms